Управление является структурным подразделением администрации муниципального района и подчиняется в своей деятельности заместителю главы администрации муниципального района, курирующего вопросы образования.
В своей деятельности управление руководствуется Конституцией Российской Федерации, законами Российской Федерации, указами и распоряжениями Президента Российской Федерации, уставами Новосибирской области и Маслянинского района, постановлениями и распоряжениями Губернатора Новосибирской области, приказами департамента Новосибирской области, постановлениями и распоряжениями Главы Маслянинского района, Положением об управлении образования.